תפקידיו של מנהל השירות הפסיכוסוציאלי-רפואי:
1. חברות בהנהלת מקום החינוך ושותפות בקביעת מדיניות הרווחה של הצוותים ושל התלמידים.
2. ניהול הצוות הפסיכוסוציאלי-רפואי וייצוגו בתוך מקום החינוך וכלפי גורמי חוץ.
3. ניהול ופיקוח על אנשי המקצוע הטיפוליים, המעניקים טיפול וליווי רגשי לתלמידים, כולל מטפלים עצמאיים (פרילנסרים).
4. הצגת הראייה הטיפולית בתוך המערכות השונות במקום החינוך (ביה"ס, פנימייה, הנהלה, משק חקלאי וכד') וזאת בנוסף לראייה החינוכית.
5. שותפות במיון ובקליטת מדריכים למקום חינוך.
6. ריכוז ו/או שותפות בתהליך מיון וקליטת תלמידים חדשים למקום החינוך.
7. זיהוי צרכים ייחודיים של התלמידים ובניית תכנית טיפול מתאימה.
8. קביעת קריטריונים וסדרי עדיפות להפניית תלמידים לטיפול ו/או לאבחון אצל העו"ס, הפסיכולוג ומטפלים אחרים. מעקב אחרי ביצוע ההפניה.
9. פיתוח פרויקטים ושירותים לרווחת התלמידים ותכניות מניעה לתופעות חריגות בקרב התלמידים (אובדנות, התמכרות, אלימות, עבודה עם ההורים וכו').
10. שמירה והגנה על זכויות התלמיד.
11. קיום ישיבות צוות קבועות עם הצוות הפסיכוסוציאלי-רפואי, מנהל הכפר, האחות, מנהל הפנימייה ומנהל בית הספר. כמו כן קיום מפגשים עם צוותי ההדרכה ועם הצוותים החינוכיים בבית ספר ומפגשים אחרים עפ"י הצורך.
12. פיתוח וליווי מקצועי של הצוות הפסיכוסוציאלי-רפואי במקום החינוך, ודאגה להמשך התפתחותו המקצועית של הצוות.
13. פיתוח ממשקי עבודה עם אגפי המינהל לחינוך התיישבותי (משרד החינוך).
14. פיתוח ממשקי עבודה עם כל המוסדות שעוסקים בתחום ילדים ונוער, לרבות מוסדות אקדמאיים מקצועיים.
15. השתתפות בהשתלמויות, בכנסים ובימי עיון שהאגף מקיים.